bet36365最快线路检测中心|首頁|欢迎您

首页 > 科学研究 > 正文

我院研究生在SCI期刊BMC Bioinformatics发表学术论文

发布时间:2020-03-06文章来源: 浏览次数:

网络空间安全学院院讯(通讯员:高震)2020218Springer Nature出版社旗下BMC系列期刊BMC Bioinformatics在线发表了我院2018软件工程专业研究生高震的学术论文(Zhen Gao, Yu-Tian Wang, Qing-Wen Wu, Jian-Cheng Ni, Chun-Hou Zheng. Graph regularized L2,1-nonnegative matrix factorization for miRNA-disease association prediction, BMC Bioinformatics, 21(61), 2020。该论文以曲阜师范大学网络空间安全学院为第一完成单位,高震为论文第一作者,倪建成教授和郑春厚特聘教授为论文共同通讯作者。BMC Bioinformatics生物信息学领域重要期刊,最新影响因子3.242,中科院分区2区。


针对当前miRNA和疾病相似性信息不完整,已知miRNA-疾病关联非常稀疏以及NMF算法不够完善的问题,GRL2,1-NMF首先度量miRNA和疾病的相似性,引入了高斯核相似性以丰富相似性信息,从而构建miRNA-疾病异构网络;由于miRNA-疾病关联矩阵极为稀疏,因此对miRNA-疾病关联矩阵进行加权K近邻处理;另外,在非负矩阵分解算法中引入吉洪诺夫正则化、拉普拉斯正则化和L2,1正则化,从而降低了过拟合,增强了数据平滑性,提高了预测潜在的miRNA-疾病对性能。最后采用五折交叉验证、留一验证以及案例研究对其进行性能评估。


全文链接:https://doi.org/10.1186/s12859-020-3409-x

该研究得到了国家自然科学基金的资助支持。

关闭 打印责任编辑:pgao

友情链接